染色体外环状DNA数据库(eccDNAdb)是一个专注于记录和理解线性染色体旁精确环状DNA的专业知识库。这种eccDNA存在于多种真核生物,包括人类,其形成可能与基因组不稳定性及DNA修复过程密切相关。数据库的构建严谨,涉及了834篇文献的手工审阅,并深入分析了SRA、GEO和ENA等公共数据库中的数据,目前共收录了1,750,158个eccDNA实例,涵盖四大类物种:智人、小鼠、鸡和酿酒酵母。信息被系统地组织起来,以便用户能以一致的方式获取关于eccDNA及其功能的详细解读。
eccDNAdb不仅提供浏览、搜索和下载数据的功能,还配备了在线BLAST服务,便于比较和分析。随着越来越多的证据揭示eccDNA在多种疾病,尤其是肿瘤发生中的关键角色,这个数据库显得尤为重要。它可能成为揭示eccDNA在疾病进展和预后中的作用的宝贵资源,同时也为将来将eccDNA纳入临床试验研究奠定了坚实的基础。
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